Из пищи замороженного волка секвенировали ядерную ДНК шерстистого носорога

Учёные впервые выделили и расшифровали ДНК шерстистого носорога из желудка древнего волчонка. Это уникальное открытие, сделанное в Якутии, позволяет по-новому взглянуть на причины вымирания этих древних животных. Подробности исследования, опубликованного в журнале Genome Biology and Evolution, приводят западные и российские авторы работы.

Шерстистые носороги были одними из самых распространённых представителей ледниковой фауны, обитавших в Евразии в эпоху плейстоцена. Окончательно вид исчез примерно 14 400 лет назад, однако точные причины его вымирания оставались предметом научных споров. Изучение ДНК могло бы дать ответы, но получить её из древних останков крайне сложно.

Прорыв стал возможен благодаря находке в 2011 году у села Тумат в Якутии мумифицированной тушки детёныша волка. Первоначально учёные предположили, что это щенок собаки, поскольку останки были обнаружены рядом со стоянкой древних людей и костями мамонта со следами обработки. Однако генетический анализ в зарубежных лабораториях показал, что это особь вымершей линии ископаемых волков.

При вскрытии в желудке волчонка были найдены непереваренные фрагменты тканей. Расшифровка их ДНК, проведённая специалистами из университетов Стокгольма, Уппсалы и Сиднея, установила, что это останки молодого шерстистого носорога. Радиоуглеродное датирование показало, что он погиб незадолго до вымирания всего вида — около 14,4 тысяч лет назад.

Учёные столкнулись с непростой задачей: отделить и восстановить ДНК добычи от ДНК хищника, учитывая возраст образцов. Однако это позволило впервые получить высококачественный геном носорога, извлечённый из желудка другого животного. Сравнив его с геномами носорогов, живших 18 и 49 тысяч лет назад, исследователи оценили генетическое здоровье популяции. Оказалось, что за 30 тысяч лет до исчезновения вид не деградировал и сохранял стабильную численность.

«Поскольку этот носорог жил примерно за 400 лет до вымирания вида, мы считаем, что катастрофа произошла в эти последние столетия. Это совпадает с началом потепления климата в конце ледникового периода», — пояснил соавтор исследования Камило Чакон-Дюк из Университета Уппсалы.

Уникальность открытия, по словам учёных, заключается в нескольких факторах: редкая сохранность образца, передовые методы извлечения ДНК и то, что это геном носорога, погибшего максимально близко по времени к моменту вымирания вида.

В 2015 году на том же месте была найдена вторая мумия волчонка. По мнению старшего научного сотрудника Музея мамонта СВФУ Сергея Фёдорова, животные могли обитать рядом с человеком, однако прямых доказательств их одомашнивания пока нет.